稳定同位素生态学研究组成立于2012年9月，以碳、氮、氧稳定同位素为主要技术手段，研究陆地生态系统碳氮循环过程特征。目前研究方向包括：
(1)农田系统陆一气交换作用;农田氮循环，东北黑土地区域耕地质量评价;
(2)全球变化背景下，采用控制实验模拟研究氮沉降、增温等对森林生态系统的影响;
(3)人为管理措施(如硅灰石添加)提升森林、农田等陆地生态系统碳汇:
(4)大气氮沉降及源解析:
(5)稳定同位素分析技术，论证设备研发;
建立了稳定同位素生态学实验室。配备同位素质谱仪（Isoprime 100）、元素分析仪（Elementar vario MICRO cube）、痕量气体制备装置（Trace Gas pre-concentrator）、自动进样器（Gilson 271 Autosampler）等整套装置2套和Gas Chromatograph（GC-2014，Shimadzu, Japan）、GC-MS（GCMS-QP2020 Ultra，Shimadzu，Japan）、Ion Chromatograph（Dionex ICS-600；Thermo Fisher Scientific Inc.）、Auto Discrete Analyzer（SmartChem 200, AMS Inc., Italy）等仪器。
建立了化学法转化铵盐和反硝化细菌法转化硝酸盐至N2O进行分析的前处理方法和装置。实验室可以测定：1）固体样品δ13C、δ15N、C%、N%；2）液态样品中可溶性各形态氮δ15N；3）气体样品中CO2、CH4和N2O的δ13C、δ15N和δ18O；4）N2O同位素异构体氮氧同位素比值。