通过高通量测序技术评估环境微生物的系统多样性和功能多样性，已成为土壤-植物生态系统研究领域的主流技术方案。为满足我所科研工作人员的微生物基因测序需求，分析测试中心于2019年7月起筹建生物测序平台。平台现引进高通量测序仪（Illumina Miseq）及外围设备系统一套。该测序系统专注靶向基因测序，性能优良（15 Gb data，25 M reads，2 × 300 bp读长），是目前费效比最优的扩增子测序解决方案。配套的周边设备包括：安捷伦生物分析仪（Agilent 2100），荧光定量仪（Qubit 3.0），PCR仪（Mastercycler X50h）等，能够进行核酸样本评估、快速建库、文库质量评估等工作。
测序平台自2019年11月底开始调试并投入使用，截至6月份共接收所内土壤、凋落物等样品一千余个。平台已完成靶向细菌16s rRNA 基因（V4，V3-V4区）、真菌ITS 基因（ITS1，ITS2区）的建库测序、初步数据分析流程构建和调试工作。面向功能基因多样性（物质循环相关）的定制化科研服务项目开发工作正在有序进行中。（分析测试中心）
图1 a,b: Agilent 2100测序文库质量评估，a： 原核16s rDNA v3-v4区测序文库，b:真核ITS1-ITS2。c: 测序碱基质量，Q30>90%。 d: 物种注释（细菌门水平）
