本课题组以微生物资源及开发利用为基础，以分子生物学和分子生态学理论和相关技术为支撑，重点开展以下四个领域的研究工作：
1．以土壤微生物生态学为主要研究方向，重点聚焦农药等有机污染物面源污染对农田土壤微生物的生态过程和生态效应，以及退化农田土壤生态系统微生物生态机理研究和调控技术等。
2．以微生物源免疫调控大分子的作用机制和应用为主要研究方向，重点开展免疫调控机理解析、生物大分子构效关系，定向结构改造，免疫抗肿瘤生物新药、新型疫苗和新型生物佐剂的开发和研制工作。
3．以微生物资源开发利用为主要研究方向，以微生物生态调控和合成微生物组学技术为手段，重点开展有机污染修复菌剂、有机污染解毒酶制剂、环境友好生物肥料、生物农药、微生物饲料添加剂、益生菌剂等方面的应用基础研究工作；
4．以完备的生物学研究平台为基础，重点开展微/纳米塑料新型污染物毒性效应、毒理机制和环境风险评估方面的基础研究。
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